3水阵型最显著的弱点在于其整体抗性和容错率相对较低。这类阵型的核心战略通常围绕冰冻控制链展开，一旦控制效果未能成功施加或被对手化解，阵型便会陷入极大的被动。由于将大量资源投入于控制和输出魂师，阵型本身往往缺乏足够坚固的前排承伤能力，导致整个体系较为脆弱。在面对具备强力解控、效果抵抗或高速突击能力的对手时，若开局未能建立控制优势，很容易被对方反手击破，从而陷入劣势就没法玩的境地。

该阵型的另壹个决定因素弱点体现在其持久作战和续航能力存在短板。虽然水系队伍中常配备治疗魂师，但阵型的核心输出玩法依赖于持续的控制衔接和伤害累积，并非瞬间爆发。在对抗拥有强大群体恢复、护盾或复活能力的阵型时，3水阵型也许面临输出不足以快速终结战斗的难题。如果战斗被拖入持久战，阵型的魂力供给、技能循环和生存压力会逐渐增大，尤其是在一些没有治疗魂师加持的组合变体中，这个难题会更加突出，因此想要持久战斗不要选它。

3水阵型的强度高度依赖命技的精准选择和魂师间的技能联动，这构成了其战略上的局限性。水队的命技选择需要在潮汐之力（恢复净化）、冰封之心（强化控制）和狂涛怒击（转化伤害）之间做出取舍，不同的选择决定了队伍是偏重PVE续航、PVP控制还是伤害补足。一旦命技选择和实战场景错配，例如在需要高生存的副本中选择了纯控制命技，整个阵型的效能便会大打折扣。这种对特定命技和魂师技能配合的深度依赖，使得阵型的构建和调整缺乏灵活性，难以应对复杂多变的战斗环境。

组建并维持壹个强力的3水阵型对资源的需求较为集中，也许带来培养压力。游戏中的高效资源分配策略往往提议将资源集中投入给三名核心魂师，而壹个成型的3水阵型通常需要多名高练度的水系魂师来支撑其控制链和输出体系。这也许导致资源分散，使得核心魂师的完全强度提高速度变慢，在和其他采用极点养成策略的阵型对抗时，也许在同资源量下处于下风。获取和培养特定的水系核心魂师本身也存在一定的门槛。

3水阵型在面对特定机制或属性克制时，其战略优势容易被针对和化解。当对手阵型配备了大量免疫控制、或能反制冰冻效果的魂师时，水系阵型的核心控制能力将大打折扣。在一些特定的游戏方法或关卡中，例如需要极高单体爆发或针对特定属性有加成的场合，纯水系阵型也许不如混合属性阵型或专精其他属性的阵型来得高效。这意味着玩家不能指望一套3水阵型应对全部战斗场景，需要根据实际情况准备备选方法。