主线任务主要围绕霍格沃茨魔法学校的场景展开，包括城堡主楼、礼堂、禁林、黑魔法防御课教室等区域。玩家需要通过完成主线任务推进剧情，解开新的学年和方法。主线任务的触发和宝箱进度直接相关，每开始3个宝箱可解开新的主线剧情，宝箱通过参和决斗、课堂、禁林等活动主题获取活跃度开始。主线任务通常包含剧情对话、寻觅解谜和战斗挑战三种形式，其中战斗关卡需根据敌方特性调整卡组策略。

主线任务的第一学年共包含28个章节，后续逐步放开第二学年等内容。任务起点位于城堡主楼的走廊，玩家需按照指引和NPC对话或调查特定物品触发剧情。部分决定因素任务如禁林探险需在指定场景（如海格小屋附近）完成战斗或收集，而无名之书系列任务则需在图书馆禁书区开始，还原原著中保卫魔法石、解救小天狼星等典范剧情。任务经过中需注意场景中的可互动元素，例如黑魔法防御课教室的柜子、魔药课教室的坩埚等。

主线任务中的战斗关卡具有明确的机制标准。例如学年挑战43关需避免运用生物类卡牌，优先选择斯内普回响配合时刻转换器等咒语卡；密室开始关卡需利用格兰芬多宝剑秒杀蛇怪；而疯狂的独角兽等新增主线则需采用多比回响进行地形规避。部分关卡设有隐藏条件，如密室入口任务需先调查三个厕所隔间才能三星通关，这些细节会直接影响奖励获取。

若出现主线任务无法推进的情况，通常是由于宝箱数量不足或等级限制。每天可通过课堂、决斗俱乐部、舞会等活动主题获取宝箱，学院活动主题每天提供200学分上限。禁林线索每天最多获取3条普通线索，紫色线索每周限2条。提议优先完成和主线重叠的日常任务，如协作任务中运用马人6次等标准可同步推进。游戏内配置-省电玩法可减少同屏玩家数量，便于点击任务目标。

主线任务奖励包含金币、钻石、回响及特定卡牌，完成整数学年还可获取金卡。部分任务如魔法石支线完成后会解开隐藏剧情和成就。随着主线进度，玩家可逐步放开决斗俱乐部段位赛、社团活动主题等方法。需注意万圣节等节日活动主题期间，限时任务如怪诞之夜需优先完成金色禁林挑战，该内容和主线无冲突但会影响资源获取效率。